Com a compositor, ha escrit repertori per a instruments solistes, així com per a diversos conjunts, des de duo fins a orquestra. El seu estil busca combinar les innovacions del segle XX amb elements tradicionals de la música occidental. Les seves obres consisteixen en cicles de cançons, sonates, música de cambra per a diverses combinacions i concerts. Moltes d'aquestes obres inclouen el piano. El 1993, el Departament de Música de la Universitat de Chicago li va atorgar una beca de quatre anys per estudiar Composició. Entre els seus professors hi havia John Eaton, Jay Alan Yim, Andrew Imbrie, Shulamit Ran i Marta Ptaszynska, Música per Informàtica i Composició amb Howard Sandroff, Direcció amb Barbara Schubert i Orquestració/Arranjament amb Cliff Colnot. Mentre estudiava a la Universitat de Chicago, va rebre el premi Paul i Olga Menn de composicions originals pel seu Concert per a piano i doble orquestra de corda.

 

Ha rebut encàrrecs d'organitzacions com el "Rhijnauwen Chamber Music Festival", la DuPage Symphony Orchestra, els Chicago Chamber Musicians, els Rembrandt Chamber Players, The Orion Ensemble i Vents de Barcelona, així com d'artistes individuals com Marion van den Akker, Keith Conant, Katinka Kleijn , Claire Chase, Eric Lamb, Noé Cantú i Elizabeth Ko. Totes les obres han estat interpretades i enregistrades en temporades de concerts anteriors. El 2004, la seva Música per a flauta i piano, enregistrada per Mary Stolper per a Cedille Records , va rebre una crítica favorable a la revista Gramophone. Ha estat compositor resident i membre del New Music Ensemble CUBE de Chicago. En aquest càrrec, va rebre una beca de l'American Composer's Forum per escriure música per a concerts infantils. Sebastian Huydts ha impartit classes al College of the University of Chicago, al Lake Forest College, a la Northwestern University i a la Merit School of Music de Chicago. Recentment, ha estat convidat com a artista resident a la Universitat de Macedònia a Tessalònica, Grècia, i ha interpretat un concert de les seves obres al Conservatori d'Atenes.

 

Actualment és professor titular i coordinador d'Estudis de Teclat i Corda a l'Escola d'Àudio i Música del Columbia College Chicago, on imparteix cursos de composició i piano i dirigeix el New Music Ensemble. A més de les seves activitats a nivell universitari, va co-ensenyar orquestració amb Cliff Colnot al programa MFA de Composició Musical per a la Pantalla. A més, va participar en el programa preuniversitari de la Sherwood Community Music School. Actuava regularment amb el Palomar Ensemble d' Access Contemporary Music i amb músics de l'Orquestra Simfònica de Barcelona i Nacional de Catalunya. La seva obra està publicada per Jeanné , especialistes en música per a instruments de vent fusta i viola.